１９９０．４〜２００３．５までの市町村合併一覧（88地域）
| 都道府県 | 件数 | 都道府県 | 件数 | 都道府県 | 件数 | 都道府県 | 件数 |
| 北海道 | 4 | 岩手県 | 4 | 宮城県 | 1 | 福島県 | 2 |
| 茨城県 | 14 | 栃木県 | 2 | 群馬県 | 5 | 埼玉県 | 7 |
| 千葉県 | 6 | 東京都 | 4 | 神奈川県 | 1 | 新潟県 | 2 |
| 山梨県 | 3 | 長野県 | 1 | 岐阜県 | 3 | 静岡県 | 2 |
| 愛知県 | 2 | 滋賀県 | 1 | 京都府 | 1 | 大阪府 | 1 |
| 兵庫県 | 1 | 奈良県 | 2 | 和歌山県 | 1 | 広島県 | 4 |
| 山口県 | 1 | 香川県 | 2 | 愛媛県 | 1 | 福岡県 | 3 |
| 熊本県 | 3 | 沖縄県 | 3 |
【詳細（日付順）】
| 変更日 | 都道府県 | 新名称等 | 施行前の状態・合併情報等 | 変更種別 |
|---|---|---|---|---|
| 2003.5.1 | 岐阜県 | 瑞穂市 | 本巣郡 穂積町, 巣南町 | 新設/市制 |
| 2003.4.21 | 山口県 | 周南市 | 徳山市, 新南陽市, 熊毛郡 熊毛町, 都濃郡 鹿野町 | 新設 |
| 2003.4.1 | 広島県 | 呉市 | 呉市, 安芸郡 下蒲刈町 | 編入 |
| 2003.4.1 | 熊本県 | あさぎり町 | 球磨郡 上村, 免田町, 岡原村, 須恵村, 深田村 | 新設 |
| 2003.4.1 | 福岡県 | 宗像市 | 宗像市, 宗像郡 玄海町 | 新設 |
| 2003.4.1 | 愛媛県 | 新居浜市 | 新居浜市, 宇摩郡 別子山村 | 編入 |
| 2003.4.1 | 広島県 | 大崎上島町 | 豊田郡 大崎町, 東野町, 木江町 | 新設 |
| 2003.4.1 | 静岡県 | 静岡市 | 静岡市, 清水市 | 新設 |
| 2003.4.1 | 岐阜県 | 山県市 | 山県郡 高富町, 伊自良村, 美山町 | 新設/市制 |
| 2003.4.1 | 山梨県 | 南アルプス市 | 中巨摩郡 白根町, 若草町, 櫛形町, 甲西町, 八田村, 芦安村 | 新設/市制 |
| 2003.4.1 | 埼玉県 | さいたま市 | 西区, 北区, 大宮区, 見沼区, 中央区, 桜区, 浦和区, 南区, 緑区 | 区制 |
| 2003.4.1 | 群馬県 | 神流町 | 多野郡 万場町, 中里村 | 新設 |
| 2003.4.1 | 宮城県 | 加美町 | 加美郡 中新田町, 小野田町, 宮崎町 | 新設 |
| 2003.4.1 | 香川県 | 東かがわ市 | 大川郡 引田町, 白鳥町, 大内町 | 新設/市制 |
| 2003.3.1 | 山梨県 | 南部町 | 南巨摩郡 南部町, 富沢町 | 新設 |
| 2003.3.1 | 広島県 | 廿日市市 | 廿日市市, 佐伯郡 佐伯町, 吉和村 | 編入 |
| 2003.2.3 | 広島県 | 福山市 | 福山市, 沼隈郡 内海町, 芦品郡 新市町 | 編入 |
| 2002.4.1 | 千葉県 | 富里市 | 印旛郡 富里町 | 市制 |
| 2002.4.1 | 香川県 | さぬき市 | 大川郡 寒川町, 長尾町, 津田町, 大川町, 志度町 | 新設/市制 |
| 2002.4.1 | 沖縄県 | 久米島町 | 島尻郡 仲里村, 具志川村 | 新設/町制 |
| 2002.4.1 | 埼玉県 | 大里町 | 大里郡 大里村 | 町制 |
| 2002.4.1 | 岩手県 | 安代町 | 二戸郡から岩手郡に | 郡変更 |
| 2002.4.1 | 沖縄県 | 豊見城市 | 島尻郡 豊見城村 | 市制 |
| 2002.2.2 | 茨城県 | 守谷市 | 北相馬郡 守谷町 | 市制 |
| 2002.11.1 | 茨城県 | つくば市 | つくば市, 稲敷郡 茎崎町 | 編入 |
| 2001.5.1 | 埼玉県 | さいたま市 | 浦和市, 大宮市, 与野市 | 新設 |
| 2001.5.1 | 埼玉県 | 川里町 | 北埼玉郡 川里村 | 町制 |
| 2001.4.1 | 千葉県 | 白井市 | 印旛郡 白井町 | 市制 |
| 2001.4.1 | 茨城県 | 潮来市 | 行方郡 潮来町,牛堀町 | 編入/市制 |
| 2001.11.15 | 岩手県 | 大船渡市 | 大船渡市, 気仙郡 三陸町 | 編入 |
| 2001.10.1 | 滋賀県 | 栗東市 | 栗太郡 栗東町 | 市制 |
| 2001.1.21 | 東京都 | 西東京市 | 田無市, 保谷市 | 新設 |
| 2001.1.1 | 新潟県 | 新潟市 | 新潟市, 西蒲原郡 黒埼町 | 編入 |
| 2000.7.1 | 熊本県 | 豊野町 | 下益城郡 豊野村 | 町制 |
| 1999.4.1 | 兵庫県 | 篠山市 | 多紀郡 今田町 篠山町, 西紀町, 丹南町 | 新設/市制 |
| 1998.10.1 | 群馬県 | 明和町 | 邑楽郡 明和村 | 町制 |
| 1997.4.1 | 茨城県 | 霞ヶ浦町 | 新治郡 出島村 | 改称/町制 |
| 1997.4.1 | 京都府 | 京田辺市 | 綴喜郡 田辺町 | 市制/改称 |
| 1997.11.4 | 北海道 | 札幌市 | 豊平区から清田区が分区 | 区再編 |
| 1997.10.1 | 茨城県 | 北浦町 | 行方郡 北浦村 | 町制 |
| 1997.10.1 | 福岡県 | 古賀市 | 糟屋郡 古賀町 | 市制 |
| 1996.9.1 | 北海道 | 石狩市 | 石狩郡 石狩町 | 市制 |
| 1996.9.1 | 北海道 | 北広島市 | 札幌郡 広島町 | 市制/改称 |
| 1996.9.1 | 茨城県 | 東町 | 稲敷郡 東村 | 町制 |
| 1996.7.1 | 群馬県 | 倉渕村 | 群馬郡 倉淵村 | 改称 |
| 1996.6.1 | 茨城県 | 新利根町 | 稲敷郡 新利根村 | 町制 |
| 1996.6.1 | 茨城県 | 河内町 | 稲敷郡 河内村 | 町制 |
| 1996.6.1 | 茨城県 | 五霞町 | 猿島郡 五霞村 | 町制 |
| 1996.4.1 | 埼玉県 | 吉川市 | 北葛飾郡 吉川町 | 市制 |
| 1996.4.1 | 千葉県 | 印西市 | 印旛郡 印西町 | 市制 |
| 1996.4.1 | 和歌山県 | 広川町 | 有田郡 広川町 | 改称 |
| 1996.11.1 | 新潟県 | 横越町 | 中蒲原郡 横越村 | 町制 |
| 1995.9.1 | 茨城県 | 鹿嶋市 | 鹿島郡 鹿島町,大野村 | 編入/改称 |
| 1995.9.1 | 東京都 | あきる野市 | 秋川市, 西多摩郡 五日市町 | 新設 |
| 1994.7.1 | 栃木県 | 上河内町 | 河内郡 上河内村 | 町制 |
| 1994.4.1 | 福島県 | 古殿町 | 東白川郡から石川郡に | 郡変更 |
| 1994.11.6 | 神奈川県 | 横浜市 | 港北区・緑区から青葉区・都筑区が分区 | 区再編 |
| 1994.11.1 | 茨城県 | ひたちなか市 | 那珂湊市, 勝田市 | 新設 |
| 1994.10.1 | 愛知県 | 日進市 | 愛知郡 日進町 | 市制 |
| 1994.10.1 | 栃木県 | 西方町 | 上都賀郡 西方村 | 町制 |
| 1994.1.1 | 沖縄県 | 与那城町 | 中頭郡 与那城村 | 町制/改称 |
| 1993.7.1 | 長野県 | 飯田市 | 飯田市, 下伊那郡 上郷町 | 編入 |
| 1993.11.1 | 茨城県 | 金砂郷町 | 久慈郡 金砂郷村 | 町制 |
| 1992.4.1 | 岩手県 | 盛岡市 | 盛岡市, 紫波郡 都南村 | 編入 |
| 1992.4.1 | 岐阜県 | 明宝村 | 郡上郡 明方村 | 改称 |
| 1992.4.1 | 東京都 | 新島村 | 大島支庁 新島本村 | 改称 |
| 1992.4.1 | 千葉県 | 八街市 | 印旛郡 八街町 | 市制 |
| 1992.4.1 | 千葉県 | 千葉市 | 中央区, 花見川区, 稲毛区, 若葉区, 緑区, 美浜区 | 区制 |
| 1992.4.1 | 福島県 | 会津本郷町 | 大沼郡 本郷町 | 改称 |
| 1992.3.3 | 茨城県 | 水戸市 | 水戸市, 東茨城郡 常澄村 | 編入 |
| 1992.10.1 | 福岡県 | 前原市 | 糸島郡 前原町 | 市制 |
| 1992.1.1 | 茨城県 | 千代田町 | 新治郡 千代田村 | 町制 |
| 1991.9.1 | 埼玉県 | 鶴ヶ島市 | 入間郡 鶴ヶ島町 | 市制 |
| 1991.5.1 | 静岡県 | 浜松市 | 浜松市, 浜名郡 可美村 | 編入 |
| 1991.4.1 | 岩手県 | 北上市 | 北上市, 和賀郡 和賀町,江釣子村 | 新設 |
| 1991.4.1 | 群馬県 | 吉岡町 | 北群馬郡 吉岡村 | 町制 |
| 1991.4.1 | 千葉県 | 袖ヶ浦市 | 君津郡 袖ヶ浦町 | 市制 |
| 1991.2.1 | 熊本県 | 熊本市 | 熊本市, 飽託郡 北部町, 河内町, 飽田町, 天明町 | 編入 |
| 1991.11.1 | 東京都 | 羽村市 | 西多摩郡 羽村町 | 市制 |
| 1991.10.24 | 奈良県 | 都祁村 | 山辺郡 都祁村 | 改称 |
| 1991.10.1 | 埼玉県 | 日高市 | 入間郡 日高町 | 市制 |
| 1991.10.1 | 大阪府 | 阪南市 | 泉南郡 阪南町 | 市制 |
| 1991.10.1 | 奈良県 | 香芝市 | 北葛城郡 香芝町 | 市制 |
| 1990.9.30 | 北海道 | 利尻富士町 | 利尻郡 東利尻町 | 改称 |
| 1990.4.1 | 愛知県 | 春日町 | 西春日井郡 春日村 | 町制 |
| 1990.4.1 | 群馬県 | 笠懸町 | 新田郡 笠懸村 | 町制 |
| 1990.10.5 | 山梨県 | 須玉町 | 北巨摩郡 須玉町 | 改称 |